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Netzwerk Bioinformatik

Das Netzwerk Bioinformatik besteht aus Bioinformatikerinnen und Bioinformatikern verschiedener Institute an der Philipps-Universität, die über spezifische Kenntnisse und Methodiken verfügen und abhängig von der jeweiligen Fragestellung passgenaue Lösungen anbieten können.

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Core Facility Bioinformatics

  Leitung
  Prof. Dr. Thorsten Stiewe
  Prof. Dr. Rolf Müller 

  Ansprechpartner
  Dr. Florian Finkernagel
  Katharina Humpert

  Website
  https://www.uni-marburg.de/de/fb20/forschung/corefacilities/bioinformatik

  Serviceleistungen
  Beratung, statistische Konzeption und Koordination von Omics-Projekten (RNAseq, GenomeSeq, ChIPseq, Ampliconseq, label free protein quantification, Phosphoproteomics)
  Standardisierte Auswertung von Projekten mittels etablierter Workflows
  Webbasierte Analysesysteme zur gezielten Interogation der Auswertungen durch Fachwissenschaftler
  Unterstützung bei Labor-Informations-Management-Systemen (LIMS)
  Entwicklung maßgeschneiderter Datenbanken, Workflows, Analysewerkzeuge und Algorithmen zur Publikation notwendige Datenbankeinreichungen ("ArrayExpress", "Gene Expression Omnibus")
  Erstellung publikationsreifer Darstellungen

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Institut für Medizinische Bioinformatik und Biostatistik

  Leitung
  Prof. Dr. Ho Ryun Chung

  Ansprechpartner
  Dr. Orestis Loukas (Machine Learning, Hochdimensionale Datenintegration)

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Institut für Humangenetik

  Leitung
  Prof. Dr. Johannes Schumacher

  Ansprechpartner
  M. Sc. Ann-Sophie Giel

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Institut für Lungenforschung

  Leitung
  Prof. Dr. Bernd Schmeck

  Anprechpartner
  Dr. Wilhelm Bertrams

  Website
  https://www.uni-marburg.de/en/fb20/departments/ciii/lung-research  

  Services
  We can provide assistance in mapping, analyzing and visualizing bulk RNA sequencing da

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Institut für Molekulare Onkologie

  Leitung
  Prof. Dr. Thorsten Stiewe

  Ansprechpartner
  Dr. Marco Mernberger (Chip-Seq, Transkriptomics, Amplican-Seq)

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Institut für Pathologie

  Leitung
  Prof. Dr. Carsten Denkert

  Ansprechpartner
  Dr. Akira Hattesohl (Bioinformatik, NGS, Transkriptomics, Single cell Analysis)

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Translationale Entzündungsforschung & Core Facility für Single Cell Multiomics

  Leitung
  Prof. Dr. Holger Garn

  Ansprechpartner
  M.Sc. Kim Pauck (Single Cell Seq & Multiomics Analysen)

• Inhalt ausklappen Inhalt einklappen Translationale Proteomics (Quantitative Proteomics)

  Leitung
  Prof. Dr. Johannes Graumann

  Ansprechpartner
  Aditya Bhagwat