Nach meinem Studium der Physik und Biophysik an der Kharazmi University und der University of Tehran promovierte ich in Molekularbiologie und Genetik an der Bogazici (Bosphorus) University in der Türkei. Im Mittelpunkt meiner Doktorarbeit stand die Charakterisierung der orthosterischen Bindungstasche eines G-Protein-gekoppelten Rezeptors (GPCR) in Thaumetopoea pityocampa, einem mediterranen Schädling. Ich nutzte sowohl In-silico- als auch In-vitro-Methoden, um Agonisten für den Allatostatin-Rezeptor in diesem Organismus zu entwickeln, die als Pestizide der nächsten Generation eingesetzt werden könnten.
Während meiner Promotion suchte ich nach zusätzlichen Kenntnissen und Fähigkeiten, indem ich verschiedene Labore besuchte. Im Jahr 2016 absolvierte ich ein Praktikum im Labor von Jana Selent an der Universität Pompeu Fabra, um mehr über molekulardynamische Simulationen und Docking-Berechnungen zu erfahren. Im Jahr 2019 wechselte ich in die Gruppe von Martin J. Lohse am MDC Berlin, um Fachwissen über Signaltests, insbesondere FRET/BRET-Techniken, zu erwerben. Diese Möglichkeiten wurden durch kurzfristige wissenschaftliche Missionsstipendien von GLISTEN (CM1207) und ERNEST (CA18133) ermöglicht. In den letzten beiden Jahren meiner Doktorarbeit vertiefte ich meine Kenntnisse der Computerchemie in der Gruppe von Serdar Durdagi in Istanbul.
Nach Abschluss meiner Promotion wurde ich Postdoc im Labor von Peter Kolb an der Universität Marburg und beteiligte mich an mehreren Studien über menschliche GPCRs, wobei ich sowohl computergestützte als auch Nasslabortechniken einsetzte. Meine Leidenschaft gilt den GPCRs und der Entwicklung von Medikamenten für diese bemerkenswerten Rezeptoren, was das Kolb-Labor zum idealen Arbeitsplatz macht.
Liste der Publikationen:
(1) Bresinsky M, Shahraki A, Kolb P, Pockes S, Schihada H. Development of Fluorescent AF64394 Analogues Enables Real-Time Binding Studies for the Orphan Class A GPCR GPR3. J. Med. Chem. (2023) doi: 10.1021/acs.jmedchem.3c01707.
(2) Shahraki A, Selent J, Kolb P. On the construction of LIECE models for the serotonin receptor 5-HT2AR. J. Comput. Aided. Mol. Des. (2023) 1:11. doi: 10.1007/s10822-023-00507-3.
(3) Durdagi S, Orhan MD, Aksoydan B, Calis S, Dogan B, Sahin K, Shahraki A, Iyison NB, Avsar T. Screening of clinically approved and investigation drugs as potential inhibitors of SARS‐CoV‐2: A combined in silico and in vitro study. Mol. Inform. (2022) 41:2100062. Mol. Inform. doi: 10.1002/minf.202100062.
(4) Birgül N, Shahraki A, Kahveci K, Düzgün MB, Gün G. Are insect GPCRs ideal next‐generation pesticides: opportunities and challenges. FEBS J. (2021) 288:272. doi: 10.1111/febs.15708.
(5) Shahraki A, Isbilir A, Dogan B, Lohse MJ, Durdagi S, Birgul-Iyison N. Structural and functional characterization of allatostatin receptor type-C of thaumetopoea pityocampa, a potential target for next-generation pest control agents. J. Chem. Inf. Model. (2021) 61:715. doi: 10.1021/acs.jcim.0c00985.
(6) Shahraki A, Yu Y, Gul ZM, Liang C, Iyison NB. Whole genome sequencing of Thaumetopoea pityocampa revealed putative pesticide targets. Genomics. (2020) 112:4203. doi: 10.1016/j.ygeno.2020.07.017. [Open Access]
(7) Iyison NB, Sinmaz MG, Sahbaz BD, Shahraki A, Aksoydan B, Durdagi S. In silico characterization of adipokinetic hormone receptor and screening for pesticide candidates against stick insect, Carausius morosus. J. Mol. Graph. Model. (2020) 101:107720. doi: 10.1016/j.jmgm.2020.107720.
