Hauptinhalt

Import der HDX-Daten in PyMol

Export der HDX-Daten aus DynamiX:

Zunächst einmal müssen die HDX-Daten aus der Auswertesoftware DynamiX exportiert werden. Das erreicht man ganz einfach durch einen Rechtsklick auf die Heat-Map-Darstellung in DynamiX und der Auswahl "PyMOL Script" (s. folgende Abbildung).

Import der HDX-Daten in PyMol:

Für den Import in PyMol hat Dr. Vitali Kalugin (ehemals AG Prof. Dr. L.O. Essen) freundlicherweise eine Kurzanleitung erstellt und uns diese zur Verfügung gestellt:

• Kurzanleitung zum Import der HDX-Daten in PyMol.

Ein Import macht natürlich nur Sinn, wenn eine entsprechende 3D-Struktur des Proteins/der Proteine of Interest exisitiert.